盡管概念性規劃是一種新引進的城市發展戰略規劃體系，但在近年來的城市實踐中，它暴露出來的問題越來越多。原因是沒有把概念性規劃上升到主題規劃，概念性規劃應有之意就應該是主題規劃，可是因為我們的概念性規劃沒有主題，所以還只是一個泛泛的城市規劃，只是在僵硬的城市總體規劃上多了點空間發展內容而已。
有一個例子說明了這方面問題：一個城市耗資2000多萬，動用幾百人，耗時兩年多，搞了一個概念性規劃。最后市長看了后說，這個概念性規劃各項指標規劃得都很好，但就是沒有一個主題貫穿其中，那我們的城市到底是一個什么城市呢？我們的城市特色又在哪里呢？
這不只是這一個城市的情況，而是大部分城市都存在的問題。
概念性規劃是一種超空間、超時空、超地域不受約束的規劃，它是針對城市總體規劃僵硬體系而應對的一種規劃，而目前這種概念性規劃和城市總體規劃造成了一種兩個極端的問題。一個是城市總體規劃體系僵死過硬，一個是概念性規劃天馬行空、異想天開。因此，導致概念性規劃和城市總體規劃之間的巨大分裂。概念性規劃本身是彌補城市總體規劃不足部分的，現在，不但沒有彌補不足，反而使概念性規劃和城市總體規劃部分差距越來越大，造成了一種空間上的分裂。
目前大部分城市的概念性規劃沒有把主題定位放在首位，而是把城市主題定位放在了次位，造成城市目標趨同、功能重復、產業同構、形象單一。　　　

究其原因，是概念性規劃設計理論的不成熟。縱觀國際，英國把概念性規劃叫做結構規劃，波蘭把概念性規劃叫做城市與區域規劃，香港把概念性規劃叫做發展策略，美國、新加坡叫做概念性規劃。可見概念性規劃的內容繁雜和相互不統一，有這么多概念性規劃模式，我們的城市究竟采用哪一種？這首先就帶來了概念性規劃的混亂性。這說明概念性規劃還不是一個嚴謹的學科，至今還沒有形成一套完整的理論，由于理論的不成熟，也導致了城市概念性規劃設計理論的不成熟。城市特色危機越演越烈，就是概念性規劃自身體系不科學性所造成的。